Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms