Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms