Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms