Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Bco1Q9JJS6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bco1Q9JJS6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bco1Q9JJS6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bco1Q9JJS6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bco1Q9JJS6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Bco1Q9JJS6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bco1Q9JJS6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Bco1Q9JJS6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bco1Q9JJS6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bco1Q9JJS6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bco1Q9JJS6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Bco1Q9JJS6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Bco1Q9JJS6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Bco1Q9JJS6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bco1Q9JJS6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bco1Q9JJS6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Bco1Q9JJS6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Bco1Q9JJS6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Bco1Q9JJS6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Bco1Q9JJS6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bco1Q9JJS6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bco1Q9JJS6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bco1Q9JJS6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Bco1Q9JJS6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Bco1Q9JJS6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Bco1Q9JJS6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Bco1Q9JJS6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Bco1Q9JJS6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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