Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms