Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms