Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI70

Mkks, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MkksQ9JI70 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MkksQ9JI70 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms