Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2ird1Q9JI57 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms