Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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