Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Usp29Q9ES63 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
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Usp29Q9ES63 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms