Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox9Q9EQM5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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