Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms