Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ndufs3Q9DCT2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ndufs3Q9DCT2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufs3Q9DCT2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ndufs3Q9DCT2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ndufs3Q9DCT2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
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Ndufs3Q9DCT2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ndufs3Q9DCT2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ndufs3Q9DCT2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ndufs3Q9DCT2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ndufs3Q9DCT2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Ndufs3Q9DCT2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufs3Q9DCT2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufs3Q9DCT2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufs3Q9DCT2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufs3Q9DCT2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufs3Q9DCT2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufs3Q9DCT2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufs3Q9DCT2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufs3Q9DCT2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufs3Q9DCT2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufs3Q9DCT2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Ndufs3Q9DCT2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufs3Q9DCT2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufs3Q9DCT2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufs3Q9DCT2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufs3Q9DCT2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufs3Q9DCT2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufs3Q9DCT2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufs3Q9DCT2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufs3Q9DCT2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufs3Q9DCT2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufs3Q9DCT2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufs3Q9DCT2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufs3Q9DCT2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufs3Q9DCT2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufs3Q9DCT2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufs3Q9DCT2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufs3Q9DCT2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufs3Q9DCT2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufs3Q9DCT2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufs3Q9DCT2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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