Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan4Q9DCK3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Tspan4Q9DCK3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Tspan4Q9DCK3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Tspan4Q9DCK3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Tspan4Q9DCK3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Tspan4Q9DCK3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Tspan4Q9DCK3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Tspan4Q9DCK3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Tspan4Q9DCK3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Tspan4Q9DCK3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Tspan4Q9DCK3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Tspan4Q9DCK3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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