Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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