Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Tmem239Q9DA47 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Tmem239Q9DA47 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Tmem239Q9DA47 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem239Q9DA47 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem239Q9DA47 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem239Q9DA47 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem239Q9DA47 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem239Q9DA47 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Tmem239Q9DA47 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem239Q9DA47 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem239Q9DA47 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem239Q9DA47 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem239Q9DA47 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem239Q9DA47 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem239Q9DA47 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem239Q9DA47 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem239Q9DA47 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem239Q9DA47 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem239Q9DA47 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem239Q9DA47 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem239Q9DA47 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem239Q9DA47 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem239Q9DA47 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Tmem239Q9DA47 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem239Q9DA47 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem239Q9DA47 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Tmem239Q9DA47 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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