Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms