Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms