Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms