Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D9

Uncharacterized protein C1orf189 homolog, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9D9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D9D9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D9D9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D9D9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D9D9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D9D9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D9D9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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Q9D9D9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D9D9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms