Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms