Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms