Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U3

Erp27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erp27Q9D8U3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Erp27Q9D8U3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Erp27Q9D8U3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms