Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P4

Mrpl17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl17Q9D8P4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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Mrpl17Q9D8P4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Mrpl17Q9D8P4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
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Mrpl17Q9D8P4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Mrpl17Q9D8P4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Mrpl17Q9D8P4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Mrpl17Q9D8P4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Mrpl17Q9D8P4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Mrpl17Q9D8P4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Mrpl17Q9D8P4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Mrpl17Q9D8P4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Mrpl17Q9D8P4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Mrpl17Q9D8P4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Mrpl17Q9D8P4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms