Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms