Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms