Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms