Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb4aQ9D6F9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms