Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Ccdc39Q9D5Y1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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