Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms