Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms