Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms