Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clvs1Q9D4C9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clvs1Q9D4C9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clvs1Q9D4C9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clvs1Q9D4C9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clvs1Q9D4C9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clvs1Q9D4C9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clvs1Q9D4C9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clvs1Q9D4C9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clvs1Q9D4C9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clvs1Q9D4C9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clvs1Q9D4C9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clvs1Q9D4C9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clvs1Q9D4C9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clvs1Q9D4C9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clvs1Q9D4C9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clvs1Q9D4C9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clvs1Q9D4C9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clvs1Q9D4C9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clvs1Q9D4C9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clvs1Q9D4C9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clvs1Q9D4C9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clvs1Q9D4C9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clvs1Q9D4C9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clvs1Q9D4C9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clvs1Q9D4C9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clvs1Q9D4C9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clvs1Q9D4C9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clvs1Q9D4C9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clvs1Q9D4C9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clvs1Q9D4C9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clvs1Q9D4C9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms