Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms