Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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