Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H0

Rita1, RBPJ-interacting and tubulin-associated protein 1, mousemouse

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Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rita1Q9D1H0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rita1Q9D1H0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rita1Q9D1H0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rita1Q9D1H0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rita1Q9D1H0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rita1Q9D1H0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rita1Q9D1H0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rita1Q9D1H0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rita1Q9D1H0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rita1Q9D1H0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rita1Q9D1H0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rita1Q9D1H0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rita1Q9D1H0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rita1Q9D1H0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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