Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms