Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mis12Q9CY25 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms