Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms