Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms