Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms