Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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