Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms