Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ddx28Q9CWT6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ddx28Q9CWT6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ddx28Q9CWT6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ddx28Q9CWT6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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