Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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