Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms