Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms