Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms