Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY8

Tm4sf20, Transmembrane 4 L6 family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf20Q9CQY8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms