Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ykt6Q9CQW1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms